Veronica est une jeune fille populaire avec un petit ami parfait. Mais tout bascule le jour où sa meilleure amie, Lilly Kane, est retrouvée assassinée. Keith Mars, son père, mais aussi le shérif de Neptune, accuse Jake Kane, le père de la victime. Ses soupçons envers les proches de la défunte crèèrent alors une polémique et Keith fut forcé d'abandonner son poste. Lianne Mars, épuisée par la pression autour de sa famille, quitte la ville du jour au lendemain et disparaît.
Veronica se retrouve sans mère et ses amis la rejettent à cause du choix qu'elle a préféré faire : choisir son père, qui est devenu un homme méprisé, plutôt que les 09ers, les enfants de riche. Elle fait la connaissance quelques temps plus tard de Wallace, qui devient son meilleur ami et qui lui rend parfois service pour ses enquêtes. Sans savoir que son père fait la même chose secrètement, Veronica va continuer d'enquêter sur le meurtre de sa meilleure amie afin de trouver l'assassin et de pouvoir enfin faire son deuil.