L'été touche à sa fin à Neptune. Trois mois ont passé et Veronica entamera alors sa dernière année de lycée ! La jeune femme a travaillé toute la saison dans un restaurant de la ville et son père est sous les feux des projecteurs en raison de la sortie de son livre sur l'affaire du meurtre de Lily. La paix serait-elle revenue sur Neptune ? Attention aux apparences...

Parker est la nouvelle victime du violeur qui sévit sur le campus. Veronica et Mac culpabilisent de ne pas avoir pu aider la jeune fille... Veronica postule pour un emploi au journal de l'université. La responsable lui confie sa première mission. Elle doit s'infiltrer dans la fraternité étudiante où Parker a passé la soirée le soir de son viol, espérant ainsi remonter jusqu'au coupable... Logan et Wallace participent à une expérience de jeu de rôles gardiens/prisonniers pour leur cours de sociologie...

Le doyen de l'université menace Veronica. Il veut l'obliger à lui révéler ses sources indiquant que de la drogue a été fournie sur le campus. La jeune femme va devoir trouver un moyen de ruser. D'autant plus qu'elle n'a pas que ça en tête. Une nouvelle mission lui est confiée par un joueur de foot qui risque bien de se faire renvoyer... Veronica tente d'aider Weevil à obtenir un boulot... Piz postule pour travailler à la radio du campus, et Logan semble avoir quelques petits secrets...

Persuadée que son époux la trompe, Harmony Chase engage Keith Mars pour trouver des preuves... Logan découvre que son héritage s'envole plus vite qu'il ne le devrait. Il prend conseil auprès de Veronica pour trouver quelqu'un de confiance afin de vérifier la comptabilité... L'une des victimes de viol mène une campagne de diffamation pour la fermeture d'une des confréries car elle est persuadée que le coupable est l'un des membres. Veronica se voit embaucher par les Pi-Sigs pour démasquer le violeur en série qui sévit sur le campus depuis quelques mois...

Keith travaille sur une nouvelle affaire. Le beau-fils du doyen de l'université est atteint d'un cancer des os. Le jeune garçon de 9 ans a besoin d'une greffe osseuse. Il leur faut retrouver un donneur compatible à temps, soit le véritable père de l'enfant... Deux hommes masqués braquent un casino sur le campus. Veronica, qui y rejoignait Logan, s'y fait voler son collier, un bijou qui a pour elle une énorme valeur sentimentale puisqu'il lui avait été offert par sa meilleure amie, Lilly Kane... Wallace obtient une note désastreuse à son examen d'ingénierie...

Veronica est surprise et flattée lorsque son professeur de criminologie lui propose d'être son directeur d'études. Mais la jeune femme se voit aussitôt accusée de plagiat sur son dernier devoir. Landry lui donne trois jours pour prouver qu'elle n'a pas triché. Veronica va devoir mener son enquête. Et la liste des suspects s'avère assez longue...

Logan assure Veronica que Mercer ne peut pas être le violeur car il était avec lui le soir où l'une des victimes s'est faite agressée. La jeune femme fulmine que son copain ne veuille pas lui en dire plus sur cet alibi... Sully, un étudiant, a disparu. Sa copine est inquiète. Il devait passer la chercher à l'aéroport et elle est sans nouvelles depuis...

Depuis l'agression, Logan se montre très protecteur envers Veronica. Il lui demande d'abandonner ses recherches sur le violeur... Selma Rose disparaît mystérieusement au cours d'une réception donnée en son honneur sur le campus. Agacé par l'attitude du shérif, le doyen demande aux Mars de la retrouver. Selma a été vue la dernière fois en train de discuter avec une serveuse...

Après sa rupture avec Logan, Veronica tente d'encaisser le choc. A l'approche d'une nouvelle soirée donnée sur le campus, elle focalise son énergie pour essayer d'éviter qu'une nouvelle victime se fasse agresser... Soupçonnant son épouse de le tromper, le doyen demande à Keith de mener son enquête...

Mme O'Dell demande à Keith de mener l'enquête sur la mort de son mari. Elle refuse de croire à un suicide... Les animaux du labo du campus ont disparu. Pour oublier sa rupture avec Logan, Veronica se concentre sur cette nouvelle affaire. Ses soupçons se portent sur un groupe d'activistes qui défendent les droits des animaux. Veronica convainc Mac de se joindre à elle pour infiltrer cette association...

Max, le spécialiste des anti-sèches, demande à Veronica de retrouver Chelsea, une fille qu'il a rencontré lors d'une convention... Keith enquête sur la mort du doyen O'Dell...

Veronica est obsédée par la vision insupportable de Logan et Madison en train de faire l'amour. Elle préfère se consacrer à sa nouvelle enquête. Une étudiante, Bonnie, veut savoir qui l'a droguée à son insu pour qu'elle fasse une fausse couche. Les premiers suspects sont les pères potentiels du bébé : Dick Casablancas et Timothy Foyle, l'assistant du professeur Landry...

Le coach de l'équipe de basket de Wallace a été assassiné. Le shérif soupçonne le fils, Josh, qui a eu une altercation avec la victime quelques heures auparavant durant un match. La veuve demande l'aide de Keith Mars pour élucider cette affaire et laver son fils de tous soupçons... Logan est très affecté par sa rupture avec Veronica. Dick tente de réconforter son ami à sa façon...

Soupçonnée d'avoir aidé Josh Barry à s'évader, Veronica est arrêtée par le shérif et jetée en prison. Keith tente de sortir sa fille de cette impasse tout en poursuivant son l'enquête sur la mort du doyen...

Désormais shérif, Keith interroge l'épouse du doyen sur le meurtre de son mari. Mise au pied du mur, la veuve finit par avouer que son époux l'a surprise avec son amant ce soir-là. Et que furieux, il avait menacé de briser la carrière de Landry... Pendant ce temps, Logan et Parker passent de plus en plus de temps ensemble...

Lorsqu'un jeune homme ivre est grièvement blessé en sortant d'un bar, Keith découvre que de nombreux bars servent de l'alcool aux mineurs... Son père ayant pris les fonction du shérif de la ville, Veronica se charge d'une affaire pour éviter de penser à Parker et Logan : les propriétaires d'un restaurant, d'origine maghrébine, sont les victimes d'attaques racistes...

Desmond Fellows, une ancienne star du rock, arrive en ville pour donner un concert avec les anciens tubes de son groupe. Piz, chargé de s'occuper de son idole, fait appel à Veronica lorsque les CD du musicien ont disparu... Logan demande à Mac de l'aider à réaliser un site web pour un projet d'école...

Keith doit faire face à une série de méfaits qui ne l'aident pas pour sa campagne. Quant à Piz, il n'obtient pas la réaction espérée en annonçant à sa petite-amie qu'on vient de lui proposer un job à New York. Veronica, après avoir passé son examen pour obtenir sa licence de privé, décroche sa première affaire en tant que professionnelle : un inconnu la recrute pour déterminer si Apollo Bukenya, l'un des étudiants de Hearst, est son fils...

Un trafic de fausses cartes d'étudiants sévit sur le campus. Deux élèves identifient Weevil comme étant leur fournisseur. Le jeune homme se retrouve une fois de plus derrière les barreaux ! Il demande de l'aide à Veronica...

Veronica apprend par Logan qu'une vidéo de Piz et elle en train de faire l'amour circule sur le net. La jeune femme mène l'enquête pour remonter à la source et découvrir qui est derrière tout ça...